O MOP foi elaborado para orientar a execução prática das 21 ações prioritárias do PIRH-Grande, traduzidas em modelos tático-operacionais representados por fluxogramas, em que constam: os responsáveis pelas ações; os procedimentos que devem ser realizados; os documentos a serem emitidos; os fluxos de informações necessários desde o início do processo até a sua conclusão; os prazos estabelecidos como ótimos; e informações complementares/adicionais.
Além disso, também é possível o acesso a uma curva de avanço da ação, que deverá evidenciar o andamento das tarefas vis à vis o que foi inicialmente previsto.
Em termos de apresentação do MOP, optou-se pela disponibilização de arquivos em formato digital com vínculos de documentos através de hiperlinks (fluxograma → especificações → detalhamentos → documentos de referência → curva de avanço da ação), buscando-se automatizar a aplicação do Manual e possibilitar a identificação de gargalos, quando for o caso, para que sejam feitas intervenções em tempo hábil.
A aplicação do MOP, nos primeiros três anos do horizonte do PIRH-Grande será efetivada tanto pela ANA quanto pelo CBH-Grande. Na primeira revisão do Plano, julga-se que a Agência de Bacia já esteja criada e caberá a ela utilizar o Manual a partir de então.